Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITPNBP48739 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms