Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GCLMP48507 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GCLMP48507 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCLMP48507 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCLMP48507 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCLMP48507 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GCLMP48507 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCLMP48507 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms