Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ME1P48163 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ME1P48163 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ME1P48163 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ME1P48163 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ME1P48163 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ME1P48163 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ME1P48163 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ME1P48163 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ME1P48163 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ME1P48163 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ME1P48163 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ME1P48163 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms