Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC6A9P48067 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms