Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms