Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCR1P46094 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCR1P46094 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCR1P46094 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCR1P46094 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
XCR1P46094 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XCR1P46094 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XCR1P46094 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XCR1P46094 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms