Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTGER3P43115 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTGER3P43115 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms