Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPOP42166 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPOP42166 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPOP42166 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPOP42166 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms