Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARL1P40616 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL1P40616 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms