Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFTPDP35247 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms