Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCKARP32238 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms