Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNTFRP26992 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CNTFRP26992 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CNTFRP26992 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CNTFRP26992 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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