Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERBB3P21860 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms