Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCNA2P20248 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms