Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms