Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CTRB1P17538 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTRB1P17538 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTRB1P17538 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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