Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms