Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL3P10147 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3P10147 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms