Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms