Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CT47B1P0C2W7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms