Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms