Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms