Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms