Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms