Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC78A2IDD5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC78A2IDD5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms