Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms