Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms