Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SH3BP1Q9Y3L3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1Q9Y3L3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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