Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX4Q9Y2E6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms