Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK1Q9UPV9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms