Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PADI1Q9ULC6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PADI1Q9ULC6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms