Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRTO4Q9UKD2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms