Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHORDC1Q9UHD1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms