Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms