Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLKQ9UBT6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms