Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
XCL2Q9UBD3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms