Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLHL13Q9P2N7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms