Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CXXC1Q9P0U4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms