Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GDE1Q9NZC3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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