Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms