Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms