Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms