Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MEPEQ9NQ76 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms