Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms