Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDCBP2Q9H190 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms