Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHACTR1Q9C0D0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms