Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP1Q9C000 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms