Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms