Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TINF2Q9BSI4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms