Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms